食品加工净化车间以采用钢混或砖砌结构为主，并根据不同产品的需要，在结构设计上，适合具体食品加工的特殊要求。
车间的空间要与生产相适应，一般情况下，生产净化车间内的加工人员的人均拥有面积(除设备外) ，应不少于1.5 平方米。
过于拥挤的净化车间，不仅妨碍生产操作，而且人员之间的相互碰撞，人员工作服与 生产设备的接触，很容易造成产品污染。
车间的顶面高度不应低于3 米，蒸煮间不应低于5 米。
加工区与加工人员的卫生设施，如更衣室，淋浴间和卫生间等，应该在建筑上为联体结构。
水产品，肉类制品和速冻食品的冷库与加工区也应该是联体式结构。
净化车间的布局既要便于各生产环节的相互衔接，又要便于加工过程的卫生控制，防止生产过程交叉污染的发生。
食品加工过程基本上都是从原料—→半成品—→成品的过程，即从非清洁到清洁的过程，因此，加工车间的生产原则上应该按照产品 的加工进程顺序进行布局，使产品加工从不清洁的环节向清洁环节过渡，不允许在加工流程中出现交叉和倒流。
清洁区与非清洁区之间要采取相应的隔离措施，以便控制彼此间 的人员流通和物流，从而避免产生交叉污染，加工品传递通过传递窗进行。
要在车间内适当的地方，设置工器具清洗，消毒间，配置供工器具清洗，消毒用的清洗槽，消毒槽和漂洗槽，必要时，有冷热水供应，热水的温度应不低于82℃。
车间的地面要用防滑，坚固，不渗水，易清洁，耐腐蚀的材料铺 制，净化车间地面表面要平坦，不积水。
车间整个地面的水平在设计和建造时应该比厂区的地面水平略高，地面有的斜坡度。
车间的墙面应该铺有2 米以上的墙裙，墙面用耐腐蚀，易清洗消毒，坚固，不渗水的材料铺制及用浅色，无毒，防水，防霉，不易脱 落，可清洗的材料覆涂。
净化车间的墙角，地角和顶角曲率半径不小于3厘米呈弧形。
净化车间的顶面用的材料要便于清洁，有水蒸气产生的作业区域，顶面所用的材料还要不易凝结水球，在建造时要形成适当的弧度，以防冷凝水滴落到产品上。
车间门窗有防虫，防尘及防鼠设施，所用材料应耐腐蚀易清洗。
窗台离地面不少于1米，并有45 度斜面。
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